Ligar notas semínimas

Começa a ficar mais claro. Veja bem, a primeira coisa que você tem que ter em mente é que há dois tipos de "ligaduras": A ligadura de duração, que prolonga a duração de uma nota e por esse motivo só vai funcionar entre notas adjacentes da MESMA altura. Em inglês, essas ligaduras recebem o nome de Ties (presta atenção porque o atalho é baseado nisso).
Além destas há as "ligaduras de expressão" ou "legato" que são aquelas ligaduras grandes que podem encampar várias notas. (acho que são essas que você está querendo reproduzir).

A primeira dica que te dou é usar os atalhos de teclado ao invés dos botões no painel de ferramentas. Para colocar as ligaduras de duração, no modo de inserção de notas, pressione T (de Tie). Ele vai adicionar uma segunda nota ligada à primeira, com a mesma duração desta. Selecione primeiro a duração da nova nota para figuras de diferentes valores (dê preferência aos atalhos de teclado 1 a 9 para alterar as figuras). Se você ainda não estiver usando a versão 4 do Musescore, o atalho é +.

Para o legato, o atalho é S (de Slur). Selecione o trecho onde quer que apareça a ligadura (no seu caso, creio que uma parte vazia do compasso para selecioná-lo todo) e pressione o atalho. Você pode também clicar apenas a primeira nota, pressionar o atalho e ir pressionando Shift+⮕ para estender a ligadura até a nota desejada.

A não ser que esteja falando de barras de ligação (beamings). Mas aí não seriam semínimas, mas colcheias.