Comparazione versioni diverse

Ho riportato su MuseScore i movimenti di una sonata così come appare sulla stampa ufficiale; ho fatto poi un successivo file riportando invece la stessa sonata secondo una fonte manoscritta. La terza fase è creare uno spartito con quattro pentagrammi: i due sopra sono la versione a stampa mentre i due sotto sono la versione manoscritta. Il problema principale è che le due versioni non si differenziano soltanto nelle note ma pure nelle battute e soprattutto c'è un "a capo" in una versione che nell'altra si trova alla battuta successiva. Non riesco a modificare una versione senza riportare le modifiche pure nell'altra.
Ho provato a colorare di bianco la stanghetta di "a capo" dove non serviva ma mi è impossibile colorare di bianco o cancellare i doppi punti.
Esiste la possibilità di operare queste modifiche?
Grazie
Silvia Nieder