Chitarra terzina vs chitarra moderna

Buongiorno a tutti.
Non sono - ahimè - un musicista, per cui ho l'abitudine di trascrivere su Musescore gli spartiti che mi interessano, per "sentire come suonano" e verificare se sono alla mia portata.
Ho uno spartito uno spartito per chitarra e pianoforte nel quale, disgraziatamente, la partitura per chitarra è per "chitarra terzina".
L'alternativa offerta è porre un capotasto in terza posizione.
Preciso che lo spartito per chitarra sembrerebbe essere in Fa# minore, mentre lo spartito per pianoforte sembra in La minore.
La domanda è: visto che preferirei evitare di usare il capotasto, come faccio a "portare" lo spartito per chitarra terzina e chitarra moderna? Devo trasportare la tonalità?
Inoltre, le due diverse tonalità possono coesistere?
Grazie a tutti in anticipo